Así como en su etapa como jugador, Rafael Márquez dejó huella a nivel institución con el FC Barcelona, pues fue clave en la formación de jóvenes en el filial que escalaron al primer equipo, que debutó Xavi Hernández y ahora están bajo las órdenes de Hansi Flick.
Márquez, ahora auxiliar técnico de Javier Aguirre en la Selección mexicana, quien tiene el objetivo de dirigir a México en el Mundial del 2030, así como volver a España para dirigir al Barcelona en Primera División, tiene como éxito haber 'terminado de pulir' a joyas como Lamine Yamal, Pau Cubarsí, Héctor Fort y Marc Casadó.
Cada uno de ellos pasó bajo la dirección técnica del apodado 'Kaiser', quien mantuvo el ADN del Barca, con un estilo que en dos temporadas lo tuvo a noventa minutos del ascenso a la Segunda División, agresivo, con la posesión de pelota y la salida al frente.